Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms