Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SphkapQ6NSW3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SphkapQ6NSW3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms