Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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NipblQ6KCD5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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NipblQ6KCD5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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NipblQ6KCD5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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NipblQ6KCD5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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NipblQ6KCD5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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NipblQ6KCD5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NipblQ6KCD5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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