Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep78Q6IRU7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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