Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap20Q6IFT4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms