Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Carmil1Q6EDY6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms