Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rftn1Q6A0D4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms