Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PnkdQ69ZP3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PnkdQ69ZP3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms