Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80dQ66JY2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms