Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms