Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usf2Q64705 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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