Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2a3Q64518 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms