Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top2bQ64511 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top2bQ64511 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms