Protein–RNA interactions for Protein: Q64436

Atp4a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp4aQ64436 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp4aQ64436 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms