Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ScxQ64124 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ScxQ64124 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ScxQ64124 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ScxQ64124 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ScxQ64124 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ScxQ64124 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms