Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Zfp248Q640N4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Zfp248Q640N4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Zfp248Q640N4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Zfp248Q640N4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Zfp248Q640N4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Zfp248Q640N4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Zfp248Q640N4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Zfp248Q640N4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Zfp248Q640N4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Zfp248Q640N4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Zfp248Q640N4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Zfp248Q640N4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp248Q640N4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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