Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col4a5Q63ZW6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms