Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Polr2kQ63871 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms