Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift52Q62559 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms