Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn4Q62472 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn4Q62472 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn4Q62472 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn4Q62472 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn4Q62472 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn4Q62472 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn4Q62472 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn4Q62472 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn4Q62472 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn4Q62472 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn4Q62472 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn4Q62472 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn4Q62472 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn4Q62472 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn4Q62472 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn4Q62472 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms