Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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