Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SnrpcQ62241 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms