Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Six1Q62231 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Six1Q62231 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Six1Q62231 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Six1Q62231 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Six1Q62231 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Six1Q62231 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Six1Q62231 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Six1Q62231 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Six1Q62231 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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