Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sycp1Q62209 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms