Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf1Q61999 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms