Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1aQ61495 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1aQ61495 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1aQ61495 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1aQ61495 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1aQ61495 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1aQ61495 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1aQ61495 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1aQ61495 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms