Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcd1Q61466 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms