Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde3bQ61409 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde3bQ61409 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms