Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2bQ61313 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms