Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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Usf1Q61069 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usf1Q61069 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usf1Q61069 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usf1Q61069 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usf1Q61069 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Usf1Q61069 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usf1Q61069 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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