Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms