Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms