Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms