Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf3Q60765 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms