Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samhd1Q60710 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms