Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms