Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm1Q60636 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm1Q60636 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms