Protein–RNA interactions for Protein: Q5YIR8

Clec4a4, C-type lectin domain family 4, member a4, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4a4Q5YIR8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clec4a4Q5YIR8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4a4Q5YIR8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4a4Q5YIR8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4a4Q5YIR8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4a4Q5YIR8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4a4Q5YIR8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4a4Q5YIR8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4a4Q5YIR8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4a4Q5YIR8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4a4Q5YIR8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4a4Q5YIR8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4a4Q5YIR8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clec4a4Q5YIR8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Clec4a4Q5YIR8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clec4a4Q5YIR8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clec4a4Q5YIR8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clec4a4Q5YIR8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Clec4a4Q5YIR8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4a4Q5YIR8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms