Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms