Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brip1Q5SXJ3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms