Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Myh1Q5SX40 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms