Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r196Q5SVD5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r196Q5SVD5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r196Q5SVD5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms