Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam71bQ5STT6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms