Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf12Q5SPL2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms