Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms