Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rtp3Q5QGU6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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