Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms