Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Nlrc3Q5DU56 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
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Nlrc3Q5DU56 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Nlrc3Q5DU56 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Nlrc3Q5DU56 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Nlrc3Q5DU56 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Nlrc3Q5DU56 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms