Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afap1l2Q5DTU0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms