Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rtl5Q5DTT4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms